Human Molecular Genetics 2013 22:07; pp. 1395–1403; doi:10.1093/hmg/dds556

Upon reviewing the data in our paper, we noticed that the annotation from annovar have wrongly identified some of the SNPs as a stop-gain mutation. By using the latest version of KGGSeq (our latest in-house pipeline), we were able to identify them as a missense mutation. These results have been further confirmed by using the annovar from KCL. It is most likely that the database of annovar we used during our analysis was unable to account for opposite strand problem, and thus reported an increased amount of stop-gain/stop-loss. With the use of the latest KGGSeq, we are able to have the correct annotation. Therefore, we would like to submit an amendment with “43 stop-gain” change to “38 stop-gain” on page 1386 and a revised Table 1 as shown below.

Table 1.

A list of 38 stop-gain or stop-loss variants identified in the DCM patient.

Chr Start End Ref Alt Het RS ID Gene Type 
chr1 1876879 1876879 het rs28548017 KIAA1751 stop-loss 
chr1 46853266 46853266 hom rs6671527 MOB3C stop-gain 
chr1 115037580 115037580 hom rs17602729 AMPD1 stop-gain 
chr1 157676964 157676964 het rs12409540 OR10J1 stop-gain 
chr1 158052037 158052037 het rs61823162 FCRL6 stop-gain 
chr3 161468918 161468918 het  IFT80 stop-gain 
chr4 70547376 70547376 het  UGT2A1 stop-gain 
chr6 31232828 31232828 hom rs3130453 CCHCR1 stop-gain 
chr7 64076102 64076102 het rs1404453 ZNF117 stop-gain 
chr8 24389875 24389875 het  ADAM7 stop-gain 
chr8 100202882 100202882 het rs7460625 VPS13B stop-gain 
chr8 134308952 134308952 het rs3739261 WISP1 stop-loss 
chr9 124431062 124431062 hom rs1476860 OR1B1 stop-gain 
chr10 27727231 27727231 hom rs2505323 PTCHD3 stop-loss 
chr11 5400712 5400712 het rs2647574 OR51Q1 stop-gain 
chr11 5834555 5834555 het rs12419602 OR52E8 stop-loss 
chr11 6592699 6592699 het  TPP1 stop-gain 
chr11 48223312 48223312 het rs7120775 OR4X2 stop-gain 
chr11 48242807 48242807 hom rs10838851 OR4X1 stop-gain 
chr11 48303590 48303590 het rs72473368 OR4C3 stop-gain 
chr11 55096228 55096228 het rs1459101 OR4C16 stop-gain 
chr11 56187792 56187792 het rs11228710 OR5AR1 stop-gain 
chr11 60021578 60021578 het rs2298553 MS4A12 stop-gain 
chr12 11353069 11353069 het rs12829245 PRB4 stop-gain 
chr13 96437820 96437820 het  OXGR1 stop-gain 
chr16 69618996 69618996 het rs1022220 HYDIN stop-loss 
chr16 79799699 79799699 het rs7499011 PKD1L2 stop-gain 
chr17 21144803 21144803 het rs55796947 MAP2K3 stop-gain 
chr17 42823857 42823857 het  C17orf57 stop-gain 
chr19 16769593 16769593 het  NWD1 stop-gain 
chr19 40410731 40410731 het rs35001809 FAM187B stop-gain 
chr19 40410860 40410860 hom rs541169 FAM187B stop-gain 
chr19 54137586 54137586 het rs10423255 DHDH stop-gain 
chr19 56696715 56696715 het rs16982743 SIGLEC12 stop-gain 
chr19 62334594 62334594 hom rs9973206 USP29 stop-gain 
chr21 30665998 30665998 het rs877346 KRTAP13-2 stop-gain 
chr22 15849049 15849049 hom rs28502153 GAB4 stop-gain 
chrX 35731048 35731048 hom rs4829392 MAGEB16 stop-gain 
Chr Start End Ref Alt Het RS ID Gene Type 
chr1 1876879 1876879 het rs28548017 KIAA1751 stop-loss 
chr1 46853266 46853266 hom rs6671527 MOB3C stop-gain 
chr1 115037580 115037580 hom rs17602729 AMPD1 stop-gain 
chr1 157676964 157676964 het rs12409540 OR10J1 stop-gain 
chr1 158052037 158052037 het rs61823162 FCRL6 stop-gain 
chr3 161468918 161468918 het  IFT80 stop-gain 
chr4 70547376 70547376 het  UGT2A1 stop-gain 
chr6 31232828 31232828 hom rs3130453 CCHCR1 stop-gain 
chr7 64076102 64076102 het rs1404453 ZNF117 stop-gain 
chr8 24389875 24389875 het  ADAM7 stop-gain 
chr8 100202882 100202882 het rs7460625 VPS13B stop-gain 
chr8 134308952 134308952 het rs3739261 WISP1 stop-loss 
chr9 124431062 124431062 hom rs1476860 OR1B1 stop-gain 
chr10 27727231 27727231 hom rs2505323 PTCHD3 stop-loss 
chr11 5400712 5400712 het rs2647574 OR51Q1 stop-gain 
chr11 5834555 5834555 het rs12419602 OR52E8 stop-loss 
chr11 6592699 6592699 het  TPP1 stop-gain 
chr11 48223312 48223312 het rs7120775 OR4X2 stop-gain 
chr11 48242807 48242807 hom rs10838851 OR4X1 stop-gain 
chr11 48303590 48303590 het rs72473368 OR4C3 stop-gain 
chr11 55096228 55096228 het rs1459101 OR4C16 stop-gain 
chr11 56187792 56187792 het rs11228710 OR5AR1 stop-gain 
chr11 60021578 60021578 het rs2298553 MS4A12 stop-gain 
chr12 11353069 11353069 het rs12829245 PRB4 stop-gain 
chr13 96437820 96437820 het  OXGR1 stop-gain 
chr16 69618996 69618996 het rs1022220 HYDIN stop-loss 
chr16 79799699 79799699 het rs7499011 PKD1L2 stop-gain 
chr17 21144803 21144803 het rs55796947 MAP2K3 stop-gain 
chr17 42823857 42823857 het  C17orf57 stop-gain 
chr19 16769593 16769593 het  NWD1 stop-gain 
chr19 40410731 40410731 het rs35001809 FAM187B stop-gain 
chr19 40410860 40410860 hom rs541169 FAM187B stop-gain 
chr19 54137586 54137586 het rs10423255 DHDH stop-gain 
chr19 56696715 56696715 het rs16982743 SIGLEC12 stop-gain 
chr19 62334594 62334594 hom rs9973206 USP29 stop-gain 
chr21 30665998 30665998 het rs877346 KRTAP13-2 stop-gain 
chr22 15849049 15849049 hom rs28502153 GAB4 stop-gain 
chrX 35731048 35731048 hom rs4829392 MAGEB16 stop-gain 

The following list summarizes those SNPs (see the revised Table 1 for detail):

  1. rs6886 in CAPG, T>C, nonsynonymous

  2. rs3183987 in PDCD6IP, A>G, synonymous

  3. rs706679 in ERBB2IP: C>T, synonymous

  4. rs3734739 in GMDS: A>G, synonymous

  5. rs1479500 in IFLTD1: T>A, nonsynonymous

Nevertheless, those changes will not affect the main findings and conclusions of our study. We apologise for those mistakes.